Παρόλο που το AdSense είναι το πιο δημοφιλές πρόγραμμα εκδότη για τη διαφήμιση PPC, εξακολουθεί να έχει προβλήματα και μειονεκτήματα. Οι διαφημιζόμενοι προτιμούν να διαφημίζονται στην αναζήτηση από τότε που έκανε το ντεμπούτο του το AdSense, επειδή πιστεύουν ότι οι επισκέπτες είναι λιγότερο στοχευμένοι. Αυτή είναι μια βάσιμη ανησυχία που έχει απόλυτη λογική. Εάν βρίσκεστε σε έναν ιστότοπο και βλέπετε μια διαφήμιση, είναι πιθανό να μην δίνετε προσοχή στο περιεχόμενο. Επίσης, το Adsense έχει γίνει τόσο δημοφιλές που οι καταναλωτές μπορούν να το ξεχωρίσουν από άλλες διαφημίσεις. Αυτό μπορεί να οδηγήσει τους ανθρώπους στο να τις αγνοούν απλά χωρίς να δίνουν περαιτέρω προσοχή.
Οι bloggers συζητούν αυτό το αμφιλεγόμενο θέμα, το οποίο μπορεί να έχει πολλή αλήθεια. Πολλοί άνθρωποι έχουν επικρίνει τη Google για αυτό, επικαλούμενοι την απόφασή της να συμπεριλάβει τις λέξεις "Ads by Google" κάτω από τη διαφήμιση. Πολλοί εκδότες επίσης δεν βγάζουν ποτέ τα χρήματα που περίμεναν όταν ξεκίνησαν το πρόγραμμα. Όσοι έχουν μόνο 30-40 επισκέπτες την ημέρα στον ιστότοπό τους, πιθανόν να μην βγάζουν ούτε ένα δολάριο την ημέρα. Πολλοί διαφημιζόμενοι αναφέρουν ποσοστά μετατροπής 1,5 έως 5 % για τη μετατροπή των επισκεπτών σε κλικ, αλλά κερδίζουν μόνο περίπου 0,10 δολάρια ανά κλικ.
Ακόμη και αν ο λογαριασμός δεν βγαίνει, δεν μπορείτε να κατηγορήσετε τις διαφημίσεις ή τη Google αν δεν έχετε αρκετούς επισκέπτες. Το κλειδί είναι να στοχεύετε στον ιστότοπό σας ανθρώπους που είναι πιθανό να κάνουν κλικ στις διαφημίσεις. Ωστόσο, υποστηρίζεται ότι άλλα προγράμματα, όπως αυτά που επιτρέπουν στους εκδότες να μοιράζονται το 75% των κερδών από τις διαφημίσεις, θα μπορούσαν να το κάνουν αυτό ευκολότερο.
Ένα άλλο μειονέκτημα του AdSense είναι ότι έχει γίνει σχεδόν αντιπαθητικό. Οι άνθρωποι έρχονται συνεχώς αντιμέτωποι με αυτό επειδή εμφανίζεται σε ιστότοπους που φαίνεται να έχουν δημιουργηθεί σε στυλ DIY. Ο μόνος τρόπος για να αντιμετωπιστεί αυτό είναι το AdSense να εξελιχθεί με τρόπο που να το κάνει πιο ελκυστικό για μεγαλύτερες μάρκες, περιορίζοντας παράλληλα εκείνους που ήδη χρησιμοποιούν το AdSense.
Το Google Adsense έχει επίσης να αντιμετωπίσει το πρόβλημα της απάτης με κλικ, το οποίο εκτιμάται ότι αντιπροσωπεύει περισσότερα από 15% όλων των κλικ σε περιεχόμενο. Ως αποτέλεσμα, οι διαφημιζόμενοι που έχουν επηρεαστεί σημαντικά από αυτό έχουν μετατοπίσει τη διαφήμισή τους σε άλλα προγράμματα ή έχουν περιορίσει τη διαφήμισή τους στην αναζήτηση. Αυτό έχει οδηγήσει σε λιγότερο ανταγωνισμό για το περιεχόμενο και κατά συνέπεια σε λιγότερα έσοδα για τους εκδότες. Οι εκδότες που συνήθιζαν να προβάλλουν πολύ κερδοφόρες διαφημίσεις αναγκάζονται τώρα να αλλάξουν το περιεχόμενό τους για να μπορούν να προβάλλουν διαφημίσεις. Αυτό οφείλεται κυρίως στα λάθη των εκδοτών, αλλά είναι ένα πρόβλημα που, αν δεν επιλυθεί, θα μπορούσε να γονατίσει το AdSense.
Το Google Adsense έχει επίσης το ελάττωμα ότι δεν χρηματοδοτεί επαρκώς τη λειτουργία αναζήτησης. Άλλα παρόμοια συστήματα προσφέρουν υψηλότερα ποσοστά και αν οι εκδότες αποφασίσουν να προτιμήσουν έναν άλλο πάροχο, οι έμποροι και οι εκδότες θα αντιμετωπίσουν προκλήσεις.
Παρόλο που η Google δεν αμείβει επαρκώς την αναζήτηση, ένα άλλο σημαντικό πρόβλημα του Adsense είναι ότι δεν διαθέτει μια ισχυρή βιβλιοθήκη γραφικών διαφημίσεων. Πολλοί διαφημιζόμενοι θα ήθελαν να προσφέρουν αισθητικά σχεδιασμένες διαφημίσεις, αλλά αυτό δεν έχει ακόμη υλοποιηθεί. Καθώς υπάρχουν διάφορα εναλλακτικά προγράμματα για τη διανομή γραφικών PPC, αυτό θα μπορούσε να προκαλέσει προβλήματα. Αν και αυτό δεν αποτελεί πρόβλημα για όλους τους εκδότες, πολλοί ισχυρίζονται ότι οι διαφημίσεις στον ιστότοπό τους δεν αλλάζουν, με αποτέλεσμα οι τακτικοί χρήστες να μην βλέπουν τις νέες διαφημίσεις και συνεπώς να μην τις επισκέπτονται.
Αυτό το πρόβλημα θα μπορούσε να λυθεί με την εναλλαγή των διαφημίσεων. Αλλά πώς θα πρέπει να συνδεθούν οι εναλλασσόμενες διαφημίσεις με τους διαφημιζόμενους που πληρώνουν μια τιμή ανά κλικ; Όλα αυτά είναι ερωτήματα στα οποία η Google πρέπει να απαντήσει εάν το Adsense πρόκειται να παραμείνει ο ηγέτης του κλάδου.
Το Adwords, από την άλλη πλευρά, έχει πολλά πλεονεκτήματα και εξακολουθεί να είναι ο ηγέτης του κλάδου. Οι διαφημιζόμενοι μπορούν να επιλέγουν τα ποσοστά CPC τους, ώστε να μπορούν να χρησιμοποιούν την υπηρεσία ακόμη και αν δεν επιτυγχάνουν τα αναμενόμενα αποτελέσματα και ταυτόχρονα να μειώνουν το κόστος τους.
Αν και εξακολουθούν να υπάρχουν κάποιες προκλήσεις με το AdSense, το πρόγραμμα παραμένει το πιο δημοφιλές στους εκδότες, ενώ το Google Adwords παραμένει το πιο δημοφιλές στους διαφημιζόμενους. Με μια βάση δεδομένων άνω των 140.000, το Adwords θα παραμείνει το πιο δημοφιλές για αρκετό καιρό ακόμη.